La teoría postulada por Florentino Ameghino se basó en la idea de que el hombre americano había surgido de una evolución no relacionada con la evolución del hombre en general, dando como resultado una paradoja en la que el hombre americano no sería descendiente del homo sapiens sino de otro homínimo, por lo tanto una especie de homo americanus.
Esta teoría fue rechazada una vez que se comprobara la teoría inmigracionista de Paul Rivet, habiendo sido demostrados los lazos filogenéticos con los pueblos mongoles y polinesios, además de haberse verificado el paso del hombre a través del estrecho de Bering y el viaje a través del pacífico.
En conclusión, la teoría autoctonista carecía de sustentación científica y fue prontamente desplazada por una teoría mucho más consistente con la evidencia biológica, cultural y hasta societal.
