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Las bacterias y cianobacterias son organismos unicelulares que pertenecen al reino Mónera que está caracterizado por una organización celular de tipo procariotas. Sin embargo estas bacterias son un tanto diferentes, ya que las cianobacterias pueden vivir aisladamente mientras que las bacterias no.
Por otro lado las bacterias algunas causan enfermedades y otras son beneficiosas para el humano, mientras que las cianobacterias se relaciona más con los protistas en la realización de la fotosíntesis y además de poseer un pigmento. En resumen ambas pertenecen al mismo reino pero su habitad y funciones son muy distintas.