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Los cilios son conocidos como un orgánulo celular formado por una pequeña proyección citoplasmática, que en la tráquea serviría de función de protección contra las partículas de polvo y otros microorganismos que entran en la respiración, mediante la filtración de éstas, evitando que lleguen a los pulmones.
Sin embargo, se puede decir que sus movimientos rítmicos facilitan la progresión y eliminación de cuerpos extraños, además pueden presentar una estructura análoga a los flagelos, pero se diferencian de los primeros en que son más cortos y mucho más numerosos.